Le substrat géologique explique en partie la formation du bas-marais. Il est composé de flysch, un substrat très hétérogènes alternant des couches d’éléments grossiers (gréseux) et des couches d’éléments très fins (argileux) bloquant l’infiltration de l’eau et formant les zones humides et les marais.

Le terme de bas-marais est réservé aux formations végétales humides qui bénéficient d’un apport en eau provenant du sous-sol, des pentes ou d’inondations temporaires. Il s’agit ici d’un marais de pente ou marais de ruissellement, avec un apport en eau superficielle, riche en substance minérale qui ruisselle sur la surface du marais. Par opposition, les hauts-marais sont alimentés uniquement par les eaux de pluie très pauvre en nutriment.