Conformément aux dispositions de l'Ordonnance sur la prévention des accidents (OPA) et de l'OLT3, le SPT est en charge des contrôles visant la protection des travailleurs qui manipulent ou qui peuvent être exposés à des microorganismes, conformément aux dispositions de l'ordonnance sur la protection des travailleurs contre les risques liés aux microorganismes (OPTM).

Partant de ce constat et étant donné que les mesures de sécurité prévues dans l'ordonnance sur l'utilisation confinée (OUC) sont similaires à celles arrêtées dans l'OPTM, le SPT s'est également vu confier les tâches de contrôle qui découlent de cette législation environnementales.

Dans ce cadre, le SPT peut compter sur le soutien et les conseils de spécialistes du laboratoire cantonal de Bâle-Ville.